Genome Biology | 东南大学林承棋团队合作开发SEU-TCA算法揭示第二心场前体细胞新亚型
AutophagyAdvances
2025-06-20 12:00
文章摘要
本研究由东南大学林承棋教授团队与同济大学魏珂教授团队合作，开发了一种新型的空间转录组整合分析工具SEU-TCA，用于解析心脏祖细胞的“空间信息编码”。该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了第二心场心脏前体细胞的空间亚型，并识别出Irx家族转录因子在前端第二心区祖细胞中的特异性表达与调控活性。研究发现IRX1可能是该亚群的关键调控因子，并通过遗传谱系追踪和条件敲除技术证实了IRX1在心脏发育中的重要作用。这一发现为理解先天性心脏病的分子基础提供了新的理论依据，并为相关诊断提供了新靶点。
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