文献解读｜浙江大学棉花精准育种团队首次绘制全球棉花功能基因变异的单倍型图谱

本研究由浙江大学棉花精准育种团队发表在Nature Communications上，创新性地开发了基于基因水平的功能单倍型变异（FH）标记，首次绘制了全球棉花功能基因变异的单倍型图谱。研究背景是传统GWAS依赖SNP标记存在局限性，难以精准定位功能基因。研究目的是通过FH标记策略，整合基因内非同义突变信息，将离散的基因组变异转化为反映蛋白质序列及功能差异的“基因单倍型”，实现农艺性状与功能基因的直接关联。研究结论显示，该方法在3724份棉花种质中定位到532个具有显著育种潜力的关键基因，并通过CRISPR-Cas9基因编辑技术验证了关键基因GhFAH1的生物学功能，证实其缺失可显著改良纤维品质。此外，FH标记还揭示了人工选择对纤维品质、产量等性状的关键优异基因的定向驯化规律，为作物高效精准育种提供了突破性工具。