专家点评CIR | 李咏生团队创建首个单细胞PTM组学图谱并揭示肝癌免疫抑制性巨噬细胞新亚型

该研究由重庆大学附属肿瘤医院李咏生团队完成，首次整合质谱流式细胞术（CyTOF）、质谱（MS）和成像质谱流式（IMC）技术，构建了单细胞水平表征蛋白质翻译后修饰（PTM）的方法。研究通过这一策略绘制了HBV阳性肝细胞癌（HCC）的PTM景观，并基于单细胞蛋白磷酸化特征鉴定出与HCC临床预后和免疫治疗反应密切相关的M2巨噬细胞新亚型。研究发现，肿瘤浸润髓系细胞的整体酪氨酸磷酸化水平显著下调，并鉴定出p-HSP27、p-STAT1和p-TRIM28三种磷酸化蛋白在M2型巨噬细胞中的异常表达。进一步将M2型巨噬细胞划分为四个亚型，发现M2-P1~P3亚型在肿瘤组织中富集，并高表达免疫抑制分子，与免疫治疗反应显著相关。该研究为肿瘤微环境的研究以及开发新型免疫治疗预测标志物提供了新思路。