文献解读｜中国农大韩振海教授团队揭示苹果属数千万年演化轨迹 发布遗传多样性全景图

中国农业大学韩振海教授团队在Nature Genetics发表研究，基于30份苹果属植物高质量基因组，系统解析了苹果属数千万年的演化历程，并构建首个苹果属图形泛基因组。研究揭示了苹果属可划分为七支系统发育类群，其起源可追溯至约5600万年前的亚洲地区。研究发现苹果属经历的苹果族早期WGD事件所产生的大量重复基因在后续的物种分化中被差异性地保留，影响基因组结构与功能的演变。此外，研究还发现苹果属内部曾发生的一次古杂交事件影响到包括多个多倍体分支在内的多数苹果属物种，伴随广泛的其他种间基因渗透，共同塑造了苹果属丰富的遗传多样性。研究构建了图形泛基因组，鉴定出物种特异的结构变异，并开发了一套选择清除分析流程用于挖掘与驯化相关的关键基因位点。