Mol Cell | Predictomes——由AlphaFold建模的蛋白质互作数据库

本文介绍了由哈佛医学院Johannes C. Walter教授及其团队开发的SPOC分类器，该分类器能够有效筛选AlphaFold-Multimer预测的高置信度蛋白质相互作用（PPIs）。研究团队构建了一个包含约300个人类基因组维护蛋白之间40,000个预测互作对的数据库predictomes.org，并通过机器学习模型训练和评估SPOC分类器。SPOC分类器在真实互作预测中表现出色，能够从大量假互作中筛选出真实互作，并在基因组维护生物通路的蛋白质互作预测中显示出强大潜力。此外，predictomes.org提供了一个用户友好的在线数据库，使研究者能够快速可视化和筛选结构预测结果，推动了蛋白质相互作用的研究和机制发现。