Nat Commun丨徐晨欢研究团队揭示转录因子局部或远程互作的新模式

本文介绍了国家生物信息中心徐晨欢研究团队在Nature Communications上发表的研究，他们开发了一种名为Footprint-C的新技术，用于在转录因子印迹分辨率下解析转录因子局部或远程互作的新模式。该技术利用DNase I消化基因组，相比传统的Hi-C技术，Footprint-C在相同测序量下能鉴定出更多的染色质环和条纹结构。研究团队通过Footprint-C技术研究了K562和HEK293T两种细胞系的染色质构象，发现了转录因子在不同细胞系中的结合偏好和共结合方式的细胞类型特异性。此外，研究还揭示了CTCF和MAZ等转录因子在染色质远程和局部互作中的不同作用，并构建了一种新型的全基因组染色质互作图谱，该图谱在分辨率上远超常规Hi-C互作图谱。这些发现揭示了转录因子间复杂的互作模式，为理解基因组复杂生命活动的调控提供了新的视角。