Genome Research | 岳家兴团队开发图形泛基因组的可视化解读新方法

本文介绍了中山大学肿瘤防治中心岳家兴团队在Genome Research上发表的研究，开发了一种名为VRPG的新方法，用于图形泛基因组的可视化解读。该方法通过线性参考基因组坐标映射，实现了对图形泛基因组的实时互动查询和浏览，以及直观的图形路径解析。VRPG不仅支持多种图形泛基因组构建策略，还能同步浏览基于线性参考基因组的多种功能注释信息，从而推动对图形泛基因组中不同图形表征的生物学功能解读。研究团队通过实例展示了VRPG在解读人类和酵母基因组中的结构变异方面的有效性，并比较了VRPG与其他可视化工具的功能和效能，显示出其在多种应用场景中的优势。