Nat. Methods | 寡核苷酸介导的邻近标记策略(O-MAP)表征RNA微环境的多组学特征

王初课题组 2024-11-09 20:00
文章摘要
本文介绍了一种名为O-MAP的新型寡核苷酸介导的邻近标记策略,用于表征RNA微环境的多组学特征。该方法无需遗传操作,通过寡核苷酸探针与目标RNA的退火杂交,结合HRP催化生成的苯氧基自由基,实现对目标RNA附近分子的生物素化富集。研究展示了O-MAP在核仁和核质中的应用,并与FISH技术兼容,显示出高灵敏度和特异性。此外,O-MAP方法还被用于蛋白质组学、转录组学和基因组学的分析,揭示了RNA微环境中的相互作用网络。总体而言,O-MAP为研究RNA微环境提供了强有力的工具,有助于深入理解RNA的功能和调控机制。
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DOI: 10.1038/s41592-024-02489-y Pub Date : 2024-11-07
IF 36.1 1区 生物学 Q1 Nature Methods
王初课题组
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