iMeta | 中科院生态中心邓晔组发布微生物代谢模型网络分析iNAP 2.0

本文介绍了中国科学院生态环境研究中心邓晔组开发的iNAP 2.0，这是一个用于微生物代谢模型网络分析的工具。iNAP 2.0整合了代谢模型的构建与分析模块，能够根据宏基因组测序数据进行微生物代谢互作的研究。该工具通过计算代谢互补与竞争系数，如PhyloMint指数、SMETANA分数和基于pFBA的代谢距离，构建和分析代谢互作网络。iNAP 2.0还创新性地使用了随机矩阵理论模型（RMT）来选择筛选代谢互作网络的阈值，并提供了代谢互作网络的构建与分析模块。该工具已在https://inap.denglab.org.cn上开放注册，并提供了测试数据供研究者使用。