JIPB | 华南农业大学夏瑞团队发布无患子科基因组数据库平台—SapBase
JIPB
2024-05-30 21:31
文章摘要
本文介绍了华南农业大学夏瑞团队开发的SapBase,一个专门为无患子科植物设计的基因组数据库平台。无患子科包含141个属和1900多个种,许多具有重要的经济价值。随着基因组技术的发展,该科植物的基因组数据大量增加,SapBase应运而生,旨在整合和管理这些数据,提供全面的数据访问和分析工具。该平台不仅存储了7种无患子科物种的基因组资源,还包括了大量的重测序和RNA-seq数据。SapBase提供了多种用户友好的功能,如Meta Search、Blast、ID Mapping等,以支持研究人员进行基因组学研究。此外,SapBase还提供了基因表达分析、蛋白质互作网络分析等高级功能,极大地促进了无患子科植物的功能和比较基因组学研究。该数据库的建立和维护得到了国家自然科学基金和广东省重点研发项目的支持,标志着无患子科研究领域的一个重要进展。
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