Adv Sci | 周永锋团队破解葡萄单倍型分辨率的三维结构变化及其对农艺性状的影响，助力葡萄全基因组智能设计

该研究由周永锋团队联合王西平团队发表在《Advanced Science》上，构建了单倍型解析的葡萄三维基因组图谱。背景：葡萄等无性繁殖作物基因组高度杂合，结构变异（SVs）积累导致两条亲本单倍型在基因含量和调控上存在显著差异，但将单倍型间结构差异转化为功能性变异的机制尚不明确。研究目的：通过整合表观基因组和转录组数据，系统揭示染色质空间折叠差异对葡萄农艺性状的影响。结论：研究发现葡萄内部两套单倍型之间存在剧烈的3D空间结构分化，其程度与品种间差异相当。该分化覆盖A/B区室及TAD边界等层面，且TAD状态存在单倍型特异性转换。研究揭示了一个由结构变异驱动的调控级联模型：TAD边界偏移等结构重排与杂合SVs密切相关，进而将线性遗传变异转化为功能性表达差异。该调控直接影响了控制果皮颜色（VvMYBA）和无核性状（VvSUS2）等核心农艺性状的基因。该研究填补了从结构变异到功能表型的空白，为葡萄精准设计育种提供了新思路。