The Innovation Life | 补齐大西洋鲑基因组“最后一块拼图”:首个近完整T2T基因组助力精准育种

TheInnovation创新 2026-07-09 00:00
文章摘要
背景:大西洋鲑是全球最具经济价值的养殖鱼类之一,其遗传改良高度依赖高质量参考基因组,但由于全基因组复制导致大量重复序列,常规测序技术难以解析端粒、着丝粒等复杂区域,致使基因组长期存在缺失。研究目的:本研究旨在构建首个大西洋鲑端粒到端粒(T2T)基因组,填补其基因组“最后一块拼图”,为解析重要经济性状的遗传基础、推动精准育种提供完整基因组学支撑。结论:借助PacBio HiFi、超长Nanopore和Hi-C等新技术,成功构建了MGB-Salmon-T2T-v1.0基因组,拼接出15条完整染色体,基因组总长2.98 Gb,Contig N50达101.69 Mb。新基因组纠正了旧版中的大尺度组装错误(如7号和14号染色体的倒位),新增2600余个高可信蛋白编码基因,并识别出IGF2R、SLC25A3等与驯化及生长性能相关的重要候选基因,揭示了胰岛素信号通路等被选择的关键分子机制,为大西洋鲑精准分子育种提供了坚实的基因组学基础。
The Innovation Life | 补齐大西洋鲑基因组“最后一块拼图”:首个近完整T2T基因组助力精准育种
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