AROH上线精选丨构建全球最大反刍动物胃肠道微生物基因组目录

本研究针对反刍动物养殖中营养高效利用与甲烷减排的双重需求，整合了全球27个国家、18种反刍动物的3567份胃肠道宏基因组样本，构建了目前规模最大、覆盖最广的反刍动物胃肠道宏基因组组装基因组目录（RGMC），获得40812个菌株水平非冗余MAGs。背景方面，反刍动物是动物源食品供应的核心，但其瘤胃发酵产生的甲烷占全球人为源甲烷排放的29.5%，是农业碳排放的主要来源。研究目的旨在通过系统解析反刍动物胃肠道微生物的代谢潜能，挖掘纤维降解酶基因资源，并锚定甲烷减排的核心微生物靶点。结论表明，RGMC目录平均映射率达52%，极大提升了宏基因组数据注释效率；系统解析了碳水化合物降解和氢代谢核心通路的类群分布与功能分化；鉴定出1082株氢营养型细菌和697株产甲烷古菌，为靶向微生物的甲烷减排技术提供了全面的基因组资源库。该目录为全球反刍动物营养生理与绿色养殖研究搭建了通用核心参考平台。