云南省农业科学院陈璇团队组装大麻野生种质资源T2T基因组并解析耐旱机制

本文报道了云南省农业科学院陈璇团队在工业大麻基因组研究中的重大突破。背景方面，工业大麻作为我国传统经济作物，现有参考基因组cs10存在组装不完整的问题，且缺乏野生种质的T2T基因组数据，而野生大麻具有更强的抗逆性。研究目的是通过组装新疆野生大麻W606的T2T基因组，并解析其耐旱机制。研究团队整合PacBio HiFi、ONT超长读长等多种测序技术，成功完成两个单倍型（HapA和HapB）的T2T基因组组装，总大小分别达737 Mb和738 Mb，N50值较之前参考基因组提升3倍以上，并精确定位了40个端粒和20个着丝粒。结论方面，通过RNA-Seq、ATAC-Seq联合分析及RT-qPCR验证，筛选出耐旱关键基因CsMYB102及其上游调控因子CsABF4和下游靶基因CsTPS9。该研究为栽培大麻的功能基因组学和抗逆性遗传改良提供了宝贵基因组资源，相关成果发表于Journal of Genetics and Genomics。