郑南宁院士领衔！北京大学/西安交通大学：小分子天然产物智能表征 | Nature Machine Intelligence

该研究由北京大学与西安交通大学等机构合作，针对小分子天然产物药物发现中周期长、数据标注有限等挑战，提出了一种名为NaFM（Foundation Model for Natural Products）的基础模型。研究目的旨在通过母核感知的预训练策略，系统刻画天然产物在生物来源、合成途径及活性间的内在关联，克服现有深度学习模型泛化能力差及分布偏移问题。NaFM结合掩码图学习与对比学习，利用COCONUT数据库中约60万条未标注结构数据进行预训练。结论显示，NaFM在天然产物分类、来源识别、活性预测等任务中表现出更强的迁移能力和鲁棒性，为天然产物智能表征与药物发现提供了有效新方法。