根据目标原核基因组预测适用的整合酶

背景：整合酶作为生物技术工具，能催化特定DNA序列重组并促进基因货物转移至基因组，但传统方法受限于目标基因组缺乏常用整合酶识别的attB位点，导致技术应用受限。研究目的：美国桑迪亚国家实验室的研究团队开发了“整合酶-按需（IOD）”软件，旨在通过生物信息学方法预测适用于广泛原核生物的位点特异性整合酶，以实现在无需外源引入attB位点的情况下进行基因组编辑。结论：IOD软件通过分类和搜索两种模式，从基因组岛数据库中识别attB/整合酶对，并在恶臭假单胞菌和细长聚球藻等细菌中验证了其预测整合酶的活性，成功消除了对非天然attB序列的依赖，为难以编辑的细菌提供了高效的基因组整合工具。