《Science》重构蛋白质相互作用的“诞生”：合成进化实验揭示天然结合界面如何从“浅滩”能景中演化出稳定、精确的“深谷”

背景：蛋白质如何形成结合位点与相互作用界面，尤其是区分天然结合表面与“不可药物化”表面的生物物理特性，是理解蛋白质功能和药物研发的关键。研究目的：斯坦福大学团队利用合成协同进化技术设计原始表面间的新相互作用，模拟蛋白质复合物的从头形成过程，以揭示天然结合界面与未进化表面的差异。结论：研究发现，天然结合位点形成的复合物聚集在深层能量阱中，结构稳定；而原始表面形成的复合物则通过浅层能量阱中的多模式对接，亲和力受限。这解释了天然结合位点易吸引结合剂的原因，并为靶向“不可药物化”表面提供了新策略。