动物研究所张金阳/赵方庆/李幸合作最新Nature子刊

背景：RNA修饰是转录后调控的关键层面，已发现超过170种化学修饰，但缺乏能同时检测多种修饰及其相互作用的方法，限制了表观转录组研究的深入。研究目的：为克服现有技术局限，中国科学院动物研究所团队开发了深度学习框架ORCA，旨在利用纳米孔直接RNA测序技术，实现对多种RNA修饰的无偏倚检测、定量分析及其相互作用图谱的全面绘制。结论：ORCA通过对抗性学习策略，成功应用于人源细胞系，不仅扩展了已知修饰位点数据库，还揭示了修饰间广泛存在的协同与竞争关系，特别是与剪接调控的串扰机制，为解析表观转录组的动态调控复杂性提供了通用工具。