Nat Med |\u00A0从一张 H&E 生成“虚拟空间蛋白组”:AI 让空间生物学更可及
BioArt
2026-01-16 07:53
文章摘要
背景:空间蛋白组学如CODEX能够原位检测多种蛋白并保留空间结构,是解析肿瘤微环境的重要工具,但成本高、流程复杂,难以在临床大规模应用。研究目的:斯坦福大学Ruijiang Li课题组提出HEX框架,旨在仅依赖常规H&E病理切片,通过AI计算生成多通道“虚拟空间蛋白组学”,并进一步与原始H&E融合(MICA),实现更准确且可解释的肺癌预后与免疫治疗预测。结论:HEX在外部泛癌种数据集上验证了可迁移性,预测蛋白表达平均Pearson’s r=0.658。MICA框架在多个独立NSCLC队列中显著提升预后预测性能(C-index从0.58提升至0.71),并在免疫治疗队列中优于PD-L1和TMB等传统标志物,同时提供可解释的空间免疫生态位线索,为低成本、可规模化的临床生物标志物发现提供了新路径。
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