北京大学席瑞斌/席建忠/哈尔滨医科大学孟宏学合作最新NCB

背景：空间转录组学技术能够捕获基因表达的空间信息，但现有数据常存在分辨率有限、噪声高和稀疏性强的问题，限制了精细结构的解析。研究目的：为解决上述挑战，本研究提出了一个名为SpaHDmap的可解释多模态降维框架，旨在通过整合空间转录组学数据与高分辨率组织学图像来提升空间分辨率并生成可解释的高分辨率空间元基因。结论：经过对合成及多种真实数据集的广泛评估，SpaHDmap能有效生成高分辨率、可解释的嵌入，揭示复杂的空间结构，且支持多样本分析和多种组织学图像类型，为深入理解组织结构提供了新工具。