文献分享 |被子植物 CLE 信号肽基因家族分析揭示旁系同源基因分化的路径、模式与预测

本文背景聚焦于被子植物中快速演化且功能多样的CLE信号肽基因家族，其序列短、注释困难，传统方法难以解析其系统发育。研究目的旨在通过开发新的注释与分析方法，全面揭示CLE基因家族的序列关系、分化路径及其功能冗余机制。结论表明，通过结合蛋白质语言模型、图嵌入分析和CRISPR基因编辑等技术，成功注释了大量CLE基因，并解析了其与LRR受体的共进化关系；研究发现CLE基因的分化与冗余受编码区变异和启动子保守性共同驱动，并可通过计算模型有效预测功能变异，为理解快速演化基因家族的分化模式提供了新见解。