Nat Biotechnol | 原发杰/常兴/卢泓远团队开发ProTrek，以自然语言“导航”蛋白质宇宙

本研究背景聚焦于传统蛋白质分析工具在序列-结构-功能关系研究中的局限性，无法实现跨模态关联且易忽视全局信息。研究目的是开发新型三模态蛋白质语言模型ProTrek，通过融合序列、结构和自然语言描述，构建统一表征空间。结论表明该模型在功能检索任务中性能提升30-60倍，成功通过湿实验验证其发现新型基因编辑酶的能力，并为蛋白质功能注释和药物设计提供技术支撑。