Mol Cell\u00A0| 生物物理研究所薛愿超团队提出circTargetMap，揭示circRNA像“分子海绵”隔离mRNA至无膜颗粒，调控基因表达

背景：环状RNA（circRNA）是一类通过前体mRNA反向剪接形成的共价闭合RNA分子，其表达具有细胞和组织特异性，在大脑中尤为丰富。尽管已知circRNA参与多种生物学过程，但其具体作用靶点和广泛的功能机制仍不明确。研究目的：中国科学院生物物理研究所薛愿超团队旨在开发一种系统性方法，在全基因组范围内绘制circRNA与靶RNA的相互作用，并探究其功能机制。他们提出了circTargetMap计算框架，并开发了颗粒RIC-seq（GRIC-seq）方法。结论：该研究鉴定出大量高可信度的circRNA-靶RNA交互作用，发现CDR1as和circRMST等circRNA可通过序列特异性碱基配对，将靶mRNA隔离至无膜颗粒处理小体（P-body）中，从而抑制靶mRNA的翻译，且该过程可能不依赖于AGO2、DICER和miRNA。研究揭示了由P-body介导的circRNA依赖性翻译抑制是一种广泛存在的调控机制，并发现致病性变异在交互位点附近富集，提示其可能与疾病相关。该工作为circRNA功能探索提供了宝贵资源和新的分析框架。