iMeta | 天津大学陈为刚组-DNA数据存储的自举式读出

iMeta 2026-03-12 19:09
文章摘要
背景:大片段DNA数据存储因其高存储密度和低成本复制潜力而备受关注,但传统读出方法依赖高覆盖度的从头组装,计算复杂度高且易受测序错误(尤其是插入/删除错误)影响。研究目的:本文提出一种基于多重隐藏参考序列的快速自举式可靠读出框架,旨在将复杂的从头读出转化为类似重测序的低复杂度流程,以降低测序覆盖度要求并提升数据恢复效率。结论:该框架通过水印参考序列滑动相关识别低错误读段,结合逐比特共识和前向-后向算法纠正错误,并在Illumina(0.2%错误率)和纳米孔(5%错误率)测序平台上验证,仅需0.6–2.5×和1.6–4.3×覆盖度即可实现无错恢复,显著优于传统组装方法,具备实际应用可行性与可扩展性。
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