Genome Biol丨spVelo-为空间转录组数据中的RNA速度准确推断提供了可能
BioArtMED
2025-08-28 14:30
文章摘要
背景：细胞测序技术发展推动了细胞轨迹重建研究，但传统单细胞RNA测序方法缺乏空间信息且仅限于单批次分析。研究目的：开发spVelo方法，通过结合变分自编码器和图注意力网络，实现多批次空间转录组数据的RNA速度准确推断。结论：spVelo在模拟数据和真实癌症数据中均优于现有方法，能有效校正批次效应、发现复杂轨迹模式、识别生物标志物，并支持基因调控网络和细胞通信等下游分析。
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