文献分享 |玉米 ARF 基因家族的 DNA 结合图谱

背景：生长素响应因子（ARF）是植物特有的转录因子家族，其在调控基因表达和植物发育中起关键作用。研究目的：本研究利用DAP-seq技术全面分析玉米中14个ARF蛋白的全基因组DNA结合特性，探究A和B进化枝的结合差异及其对生长素响应基因的调控机制。结论：发现A进化枝偏好结合近端启动子区的TGTCGG基序，而B进化枝倾向结合远端富含胞嘧啶尾巴的TGTC基序；染色质可及性影响ARF的组织特异性结合；机器学习模型成功预测了不同玉米自交系中ARF结合的差异，并通过实验验证。