Nat Commun | 香港城市大学李帅成揭示了寻找空间可变的配体-受体相互作用以及下游基因的功能支持

iNature 2025-08-24 09:00
文章摘要
背景:空间转录组学技术为研究具有空间变异性的细胞间配体-受体相互作用(LRI)提供了突破性工具,但现有方法在识别空间可变LRI(SVI)时存在忽略功能验证和计算可扩展性等挑战。研究目的:香港城市大学李帅成团队开发了SPIDER方法,旨在通过构建细胞相互作用界面,结合概率模型和下游靶基因功能支持,准确识别具有生物学意义的SVI。结论:SPIDER在模拟和真实数据集中表现出更高的准确性、特异性和稳健性,能够有效识别SVI并验证其与下游基因的相关性,为细胞相互作用研究提供了新工具。
Nat Commun | 香港城市大学李帅成揭示了寻找空间可变的配体-受体相互作用以及下游基因的功能支持
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