文献分享|PTM-Mamba:一种具有双向门控 Mamba 模块的翻译后修饰感知蛋白质语言模型

林木多组学研究 2025-08-21 14:32
文章摘要
背景:翻译后修饰(PTM)如磷酸化、乙酰化等对蛋白质功能多样性至关重要,其失调与多种疾病相关。现有蛋白质语言模型(如ESM-2)未涵盖PTM表征。研究目的:开发PTM-Mamba模型,通过双向门控Mamba模块融合PTM标记与ESM-2嵌入,实现对野生型和PTM序列的联合建模。结论:模型在疾病预测、药物性评估和零样本PTM发现任务中优于基线模型,成为PTM感知蛋白质建模的基础工具,为精准医学提供新范式。
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