中科院深圳先进院张成辛研究员Nature Protocols：通用蛋白与核酸结构比对新算法US-align

本文介绍了中国科学院深圳先进技术研究院张成辛研究员团队开发的通用结构比对工具US-align。该工具支持蛋白质、DNA、RNA及其复合物的快速统一比对，具备命令行、PyMOL插件和网页服务器三种使用方式。US-align基于TM-score打分函数，能够处理单体、复合物、多结构、序列和非序列顺序比对，以及循环排列比对任务。相较于早期版本，最新版US-align增加了循环排列结构比对模块和批量结构比对功能，并支持多种可视化方式。文章还指出，未来US-align将开发柔性结构比对算法以应对构象变化较大的蛋白与核酸结构。