文献分享 | Nat. Commun.：利用新型大规模RNA分析技术破译表观遗传修饰化合物的直接转录效应

本研究通过单细胞与mini-bulk 4sU标记新RNA测序技术，系统解析了表观遗传小分子对转录的直接影响。研究背景是传统的RNA-seq分析难以精确捕捉表观遗传化合物的直接转录效应，而现有技术耗时且规模有限。研究目的是开发一种高通量新生RNA谱分析策略，以捕捉表观遗传化合物的直接转录效应。研究结果显示，HDAC抑制剂SAHA在30–60分钟内即可扰动数百基因，其效应与BRD4、YY1等转录因子结合位点动态相关。扩展至83种化合物，发现HDAC与溴结构域抑制剂呈现类别特异性转录响应。该技术为药物作用机制与脱靶效应研究提供了高时效、高分辨的转录组学工具。