APS｜AlphaFold3预测的GPCR-小分子复合物评测

本研究评估了AlphaFold3在预测G蛋白偶联受体（GPCR）与小分子配体复合物结构中的表现。研究团队收集了74个GPCR-小分子配体复合物实验结构，比较AlphaFold3预测结果与实验结构之间的差异。结果表明，AlphaFold3在整体受体骨架预测方面表现优秀，但在小分子配体定位方面存在显著不稳定性，尤其在新型配体和别构调节剂上更为明显。此外，AlphaFold3在处理新颖或未充分表征的别构结合模式时能力仍显不足，难以满足结构基础药物设计的精度需求。研究建议未来可通过引入物理化学原则、优化能量评估模块及整合生物学功能信息等方式，进一步提升AlphaFold3在GPCR-配体复合物预测中的表现。