JIA｜北京市农林科学院甜瓜课题组在甜瓜果皮颜色基因鉴定及分子标记开发方面取得新进展

本研究以灰绿色果皮甜瓜自交系B8和白色果皮自交系B15为材料，构建了近等基因系NIL-G，并通过遗传分析发现深绿色果皮性状受单显性基因控制。通过BSA-seq及基因精细定位，将目标基因定位在4号染色体的263.7kb区间内，包含已知功能的CmAPRR2基因。序列分析发现该基因在NIL-G和B15之间存在四个SNP变异，其中SNP.G614331A的突变导致B15中CmAPRR2基因的转录本发生可变剪接，进而影响蛋白结构域。基因表达分析显示CmAPRR2在NIL-G中的表达水平显著高于B15，推测其为控制甜瓜深绿色果皮的关键基因。此外，基于SNP.G614331A开发了KASP分子标记APRR2-G/A，该标记与果皮颜色表型共分离。研究结果为甜瓜果皮颜色调控机制提供了理论基础，并为分子标记辅助选择育种提供了工具。