Microbiome | 宏基因组分析揭示三种模式动物小鼠、猪、食蟹猴肠道噬菌体多样性

本研究通过宏基因组分析，系统性地研究了小鼠、猪、食蟹猴三种模式动物肠道噬菌体的多样性。研究团队利用生物信息学方法，从大量宏基因组数据中挖掘出高质量病毒序列，构建了hcMGV、hcPGV、hcCMGV数据库，发现其中大部分噬菌体与已知病毒数据库相似度较低，扩展了模式动物肠道噬菌体的多样性。研究还鉴定到315条crAss样噬菌体和243条巨型噬菌体，部分巨型噬菌体包含CRISPR-Cas系统，具有基因编辑工具的潜力。比较分析显示，猪和食蟹猴肠道噬菌体之间的相似性高于小鼠，且食蟹猴肠道噬菌体与人类肠道微生物的关联更为密切。该研究为未来相关领域的研究提供了高质量的参考数据。