Genome Med丨林承棋团队开发SEU-TCA算法揭示第二心场前体细胞新亚型

本研究由东南大学林承棋教授团队联合多家研究机构开发了一种新型的空间转录组整合分析工具SEU-TCA（Spatial Expression Utility - Transfer Component Analysis），用于解析心脏祖细胞的“空间信息编码”。研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据，揭示了第二心场心脏前体细胞的空间亚型，并识别出Irx家族转录因子在前端第二心区（aSHF）祖细胞c2亚群中的特异性表达与调控活性。研究发现IRX1阳性细胞参与构建流出道（OFT）和右心室（RV），并且Irx1的缺失会导致室间隔缺损（VSDs）。这一发现为理解先天性心脏病的分子基础提供了新的理论依据，并为先天性心脏病的诊断提供了新靶点。