Nat Commun丨哈尔滨工业大学蒋庆华等研究提出了一个可以在原子水平上准确识别T细胞抗原的deepAntigen深度学习框架

本文介绍了哈尔滨工业大学蒋庆华等研究人员提出的deepAntigen深度学习框架，该框架能够在原子水平上准确识别T细胞抗原。研究背景指出，T细胞抗原的精确鉴定对于癌症mRNA疫苗的开发至关重要，但现有方法仅利用序列水平特征，导致抗原代表性不佳。研究目的是通过deepAntigen框架，结合图卷积网络，预测抗原-HLA结合和抗原-TCR相互作用，从而全面指导T细胞抗原的鉴定。实验验证表明，deepAntigen在肺癌、乳腺癌和胰腺癌患者中预测的肿瘤新抗原成功激活了CD8+T细胞释放IFN-γ。结论认为，deepAntigen在原子水平上的高精度识别能力将加速个性化新抗原靶向免疫治疗的开发。