Nat. Chem. Biol. | TOPO-seq揭示了DNA拓扑结构导致的Cas9和碱基编辑器的脱靶活性
王初课题组
2025-04-16 20:00
文章摘要
本文介绍了发表在Nat. Chem. Biol.上的一项研究，开发了一种名为TOPO-seq的新技术，用于检测DNA拓扑结构导致的Cas9和碱基编辑器的脱靶活性。研究背景是CRISPR-Cas基因组编辑工具在基础研究和转化医学中广泛应用，但脱靶事件的安全性至关重要。研究目的是通过TOPO-seq技术揭示DNA拓扑结构对Cas9切割活性的影响。TOPO-seq包括体外“筛选”和体内“验证”两步，通过构建不同拓扑结构的DNA库，发现DNA拓扑结构会影响Cas9对间隔区错配的容忍度。研究结论表明，TOPO-seq能有效识别DNA拓扑结构引起的脱靶位点，为基因组编辑的安全性提供了新见解。
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