【CCS Chem.】武汉大学袁必锋课题组：双链DNA脱氨测序法绘制DNA羟甲基修饰单碱基分辨率全基因组图谱

本文介绍了武汉大学袁必锋教授课题组开发的一种新型双链DNA脱氨测序法（DDD-seq），用于实现基因组中5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的单碱基分辨率测序。该方法利用新型双链脱氨酶SsdAcat对双链DNA中胞嘧啶及其修饰形式的差异性脱氨基活性，能够高效地对C、5mC、5caC和5fC进行脱氨基处理，而对糖基化保护的5hmC（5gmC）不进行脱氨基，从而实现对5hmC的测序和定量分析。DDD-seq具有无需亚硫酸氢盐处理、操作简便、适用范围广、无序列偏好性等优点。作者利用该方法绘制了小鼠小脑组织基因组中5hmC的单碱基分辨率图谱，并揭示了慢性睡眠剥夺对5hmC位点的影响。这一技术的建立为深入揭示5hmC的生物学意义提供了新的工具。