如何让肿瘤蛋白质组学检测更高效？超声打“辅助”发Nature子刊！

本文介绍了张会教授团队在《Nature Protocols》上发表的研究，旨在通过引入超声处理步骤优化蛋白质提取方法，提高膜结合蛋白和DNA结合蛋白的检测效率。研究基于临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）项目，通过质谱技术对肿瘤组织进行定量蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析。实验结果显示，超声处理显著提高了蛋白质组和磷酸化蛋白质组的检测深度和覆盖范围，尤其是在乳腺癌的两种亚型中。此外，超声处理还揭示了与肿瘤进展相关的潜在调控机制和治疗靶点。该方法适用于多种生物样本，并与现有蛋白质组学分析流程无缝对接，为癌症研究提供了更全面和深入的分析手段。