Science | 利用构象系综分析丝氨酸水解酶催化能力的来源

本文探讨了丝氨酸水解酶的催化机理，通过分析17种丝氨酸水解酶的1231个高精度结构，建立了模拟催化路径的构象系综。研究重点在于理解酶如何加速化学反应，特别是当存在亲核丝氨酸残基与水具有几乎相同的反应性时。作者通过量化分析亲核试剂相对于底物酰胺羰基的位置参数，发现酶中的反应路径被缩短，分子移动被限制在有利于反应进行的侧链旋转过程中，从而加速反应。研究提出了一个定量的模型，解释了酶加速反应速率的来源，强调了在催化过程中既需要灵活性又不能过于灵活，同时也需要刚性但不能过于刚性的重要性。