四川大学刘祥根团队：通过自适应模拟退火算法进行靶点特异药物设计

本文介绍了四川大学刘祥根团队在Bioinformatics上发表的研究，提出了一种名为TargetSA的新框架，该框架利用自适应模拟退火（SA）算法进行靶点特异药物分子生成和多约束优化。研究背景是靶向药物设计领域面临的挑战，如依赖复杂数据集和忽视多约束优化问题。研究目的是通过SA算法探索药物分子的化学空间，生成与靶点紧密结合、具有高药物相似性和合成可及性的新化合物。实验结果表明，TargetSA在性能上超越了现有方法，特别是在结合亲和力、类药性和合成可及性方面。结论是TargetSA框架为靶点特异性药物发现提供了一种有效的方法，无需对广泛的蛋白质配体复合物进行预训练，具有广泛的应用潜力。