Nat Mach Intell | 田永鸿/陈杰团队提出进化启发的深度学习通用预测框架,实现跨病毒类型的统一预测
BioArt
2025-01-25 09:10
文章摘要
本文介绍了北京大学信息工程学院田永鸿教授和陈杰副教授团队在Nature Machine Intelligence上发表的研究,提出了一种基于进化论的深度学习框架E2VD,用于跨病毒类型和毒株类型的统一预测。该研究通过定制化的蛋白质语言模型和创新的“微弱突变放大”与“稀少有益突变挖掘”技术,解决了病毒进化中的两大难题:少数位点突变和稀少有益突变。E2VD框架在多个病毒进化预测任务中表现出色,显著提升了预测精度,特别是在稀少有益突变的预测上,精度从13%提升至80%。此外,E2VD展示了强大的泛化能力,适用于多种病毒类型,包括新冠病毒、寨卡病毒、流感病毒和艾滋病病毒。该研究不仅为疫苗和药物的快速更新提供了工具,也为理解物种复杂进化机制提供了新的视角。
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