蛋白预测从数月缩短至数小时，MassiveFold出于AlphaFold而胜于AlphaFold3

MassiveFold是由法国里尔大学和瑞典林雪平大学的科学家开发的一种优化和可定制的蛋白质结构预测工具，它基于AlphaFold并进行了并行化和大规模采样的改进。MassiveFold通过将计算任务分配到CPU和GPU之间，显著缩短了蛋白质结构预测的时间，从数月缩短至数小时。研究显示，MassiveFold在多个CASP15靶标上的表现优于AlphaFold3，特别是在复杂蛋白质组装的建模上。该工具的开发解决了AlphaFold在GPU资源需求高和处理时间长的问题，具有高度的可扩展性和灵活性，适用于从单台计算机到大型GPU基础设施的各种计算环境。MassiveFold的代码已在GitHub和Zenodo上公开，便于研究人员使用和进一步开发。