JIPB | 河南大学张学斌团队开发植物代谢组学数据分析流程:MetMiner

JIPB 2024-09-11 09:59
文章摘要
河南大学张学斌团队开发了一款名为MetMiner的用户友好型大规模植物代谢组学数据分析流程。该流程基于R-shiny开发,具有交互性强的图形界面,适用于处理大样本量的代谢组学数据。MetMiner由三部分组成:上游数据处理、下游数据分析和进阶数据挖掘。上游数据处理通过tidyMass框架确保数据分析的透明性和可重复性;下游数据分析包括代谢物的注释、分类和富集分析;进阶数据挖掘通过迭代WGCNA策略构建代谢物共积累网络。研究还通过实际案例展示了MetMiner在群体规模代谢组学数据挖掘中的准确性和高效性。
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