Influence of microorganisms and arbuscular mycorrhizal fungi on the metabolome of Lotus japonicus exudate Einfluss von Mikroorganismen und arbuskulären Mykorrhiza-Pilzen auf das Metabolom von Lotus japonicus Exsudat

Sabrina Schalk, Prof. Dr. Thomas Hofmann
{"title":"Influence of microorganisms and arbuscular mycorrhizal fungi on the metabolome of Lotus japonicus exudate\n Einfluss von Mikroorganismen und arbuskulären Mykorrhiza-Pilzen auf das Metabolom von Lotus japonicus Exsudat","authors":"Sabrina Schalk,&nbsp;Prof. Dr. Thomas Hofmann","doi":"10.1002/lemi.202552247","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<p>Die steigenden Anforderungen an die Landwirtschaft, einschließlich veränderter Umweltbedingungen, wachsender Konkurrenz um Ackerland und veränderten Verbraucherpräferenzen, erfordern innovative Ansätze in der Pflanzenzüchtung. Im Mittelpunkt stehen die Entwicklung stressresistenter Genotypen und die Verbesserung der Pflanzenerträge. Metabolomik-Studien liefern wichtige Erkenntnisse über pflanzliche Metaboliten, die Qualitätsparameter wie Nährwert, Geschmack, Textur und Toxizität beeinflussen. Insbesondere die Wechselwirkungen zwischen Pflanzen und arbuskulären Mykorrhiza-Pilzen (AM) haben großes Potenzial zur Optimierung landwirtschaftlicher Systeme. Diese Symbiose fördert das Pflanzenwachstum und verbessert die Nährstoffaufnahme, ist jedoch durch den temporären Kollaps der Arbuskeln begrenzt.</p><p>Die vorliegende Arbeit untersucht die Auswirkungen der AM-Symbiose auf das Metabolom der Modellpflanze <i>Lotus japonicus</i>. Mithilfe von Massenspektrometrie-Analysen und statistischen Auswertungen wurden Sojasaponine als Marker-Metaboliten identifiziert, die unter mykorrhizierten Bedingungen in höheren Konzentrationen auftreten. Diese wurden isoliert, mittels NMR-Experimenten strukturell charakterisiert und ihre fungiziden Eigenschaften gegenüber AM-Pilzen in Bioassays nachgewiesen. Eine selektive UHPLC-MS/MS-Methode wurde entwickelt, um Sojasaponine in verschiedenen Proben zu quantifizieren und deren Rolle in der Symbiose zu analysieren. Es zeigte sich, dass Mutanten mit reduziertem Sojasaponin-Gehalt eine verbesserte AM-Besiedlung aufwiesen, was deren potenziellen Einsatz in der Landwirtschaft unterstreicht.</p><p>Darüber hinaus wurde ein synthetisches Exsudat (SynEx) entwickelt, das primäre Metaboliten enthält, welche das Wachstum symbiotischer Mikroben (<i>Acidovorax delafieldii</i>) fördern. Dieses ermöglicht zukünftige Studien zu den synergistischen Effekten von Mikroorganismen in der Rhizosphäre. Die Ergebnisse liefern neue Erkenntnisse über die Wechselwirkungen zwischen pflanzlichen Metaboliten, Mikroorganismen und AM-Pilzen und legen die Grundlage für nachhaltige Strategien zur Verbesserung von Ernteerträgen und funktionalen Lebensmitteln. Langfristig könnten diese Ansätze zu einer nachhaltigeren Landwirtschaft mit optimierten Pflanzensymbiosen beitragen.</p><p>The increasing challenges faced by agriculture, including shifting environmental conditions, heightened competition for arable land, and changing consumer preferences, demand innovative approaches in plant breeding. Central to these efforts are the development of stress-resistant genotypes and the improvement of crop yields. Metabolomic studies provide critical insights into plant metabolites that influence quality parameters such as nutritional value, flavor, texture, and toxicity. In particular, the interactions between plants and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) hold significant potential for optimizing agricultural systems. This symbiosis promotes plant growth and enhances nutrient uptake but is limited by the temporary collapse of arbuscules.</p><p>This study investigates the impact of AM symbiosis on the metabolome of the model plant <i>Lotus japonicus</i>. Using mass spectrometry analyses and statistical evaluations, soyasaponins were identified as marker metabolites present at higher concentrations under mycorrhizal conditions. These metabolites were isolated, structurally characterized through NMR experiments, and their fungicidal properties against AMF were demonstrated in bioassays. A selective UHPLC-MS/MS method was developed to quantify soyasaponins in various samples and analyze their role in the symbiosis. It was observed that mutants with reduced soyasaponin levels exhibited improved AM colonization, highlighting their potential application in agriculture.</p><p>Furthermore, a synthetic exudate (SynEx) was developed, containing primary metabolites that support the growth of symbiotic microbes such as Acidovorax delafieldii. This synthetic exudate facilitates future studies on the synergistic effects of microorganisms in the rhizosphere. The findings provide new insights into the interactions between plant metabolites, microorganisms, and AMF, forming the basis for sustainable strategies to improve crop yields and functional foods. 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Abstract

Die steigenden Anforderungen an die Landwirtschaft, einschließlich veränderter Umweltbedingungen, wachsender Konkurrenz um Ackerland und veränderten Verbraucherpräferenzen, erfordern innovative Ansätze in der Pflanzenzüchtung. Im Mittelpunkt stehen die Entwicklung stressresistenter Genotypen und die Verbesserung der Pflanzenerträge. Metabolomik-Studien liefern wichtige Erkenntnisse über pflanzliche Metaboliten, die Qualitätsparameter wie Nährwert, Geschmack, Textur und Toxizität beeinflussen. Insbesondere die Wechselwirkungen zwischen Pflanzen und arbuskulären Mykorrhiza-Pilzen (AM) haben großes Potenzial zur Optimierung landwirtschaftlicher Systeme. Diese Symbiose fördert das Pflanzenwachstum und verbessert die Nährstoffaufnahme, ist jedoch durch den temporären Kollaps der Arbuskeln begrenzt.

Die vorliegende Arbeit untersucht die Auswirkungen der AM-Symbiose auf das Metabolom der Modellpflanze Lotus japonicus. Mithilfe von Massenspektrometrie-Analysen und statistischen Auswertungen wurden Sojasaponine als Marker-Metaboliten identifiziert, die unter mykorrhizierten Bedingungen in höheren Konzentrationen auftreten. Diese wurden isoliert, mittels NMR-Experimenten strukturell charakterisiert und ihre fungiziden Eigenschaften gegenüber AM-Pilzen in Bioassays nachgewiesen. Eine selektive UHPLC-MS/MS-Methode wurde entwickelt, um Sojasaponine in verschiedenen Proben zu quantifizieren und deren Rolle in der Symbiose zu analysieren. Es zeigte sich, dass Mutanten mit reduziertem Sojasaponin-Gehalt eine verbesserte AM-Besiedlung aufwiesen, was deren potenziellen Einsatz in der Landwirtschaft unterstreicht.

Darüber hinaus wurde ein synthetisches Exsudat (SynEx) entwickelt, das primäre Metaboliten enthält, welche das Wachstum symbiotischer Mikroben (Acidovorax delafieldii) fördern. Dieses ermöglicht zukünftige Studien zu den synergistischen Effekten von Mikroorganismen in der Rhizosphäre. Die Ergebnisse liefern neue Erkenntnisse über die Wechselwirkungen zwischen pflanzlichen Metaboliten, Mikroorganismen und AM-Pilzen und legen die Grundlage für nachhaltige Strategien zur Verbesserung von Ernteerträgen und funktionalen Lebensmitteln. Langfristig könnten diese Ansätze zu einer nachhaltigeren Landwirtschaft mit optimierten Pflanzensymbiosen beitragen.

The increasing challenges faced by agriculture, including shifting environmental conditions, heightened competition for arable land, and changing consumer preferences, demand innovative approaches in plant breeding. Central to these efforts are the development of stress-resistant genotypes and the improvement of crop yields. Metabolomic studies provide critical insights into plant metabolites that influence quality parameters such as nutritional value, flavor, texture, and toxicity. In particular, the interactions between plants and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) hold significant potential for optimizing agricultural systems. This symbiosis promotes plant growth and enhances nutrient uptake but is limited by the temporary collapse of arbuscules.

This study investigates the impact of AM symbiosis on the metabolome of the model plant Lotus japonicus. Using mass spectrometry analyses and statistical evaluations, soyasaponins were identified as marker metabolites present at higher concentrations under mycorrhizal conditions. These metabolites were isolated, structurally characterized through NMR experiments, and their fungicidal properties against AMF were demonstrated in bioassays. A selective UHPLC-MS/MS method was developed to quantify soyasaponins in various samples and analyze their role in the symbiosis. It was observed that mutants with reduced soyasaponin levels exhibited improved AM colonization, highlighting their potential application in agriculture.

Furthermore, a synthetic exudate (SynEx) was developed, containing primary metabolites that support the growth of symbiotic microbes such as Acidovorax delafieldii. This synthetic exudate facilitates future studies on the synergistic effects of microorganisms in the rhizosphere. The findings provide new insights into the interactions between plant metabolites, microorganisms, and AMF, forming the basis for sustainable strategies to improve crop yields and functional foods. In the long term, these approaches could contribute to more sustainable agriculture through optimized plant symbioses.

微生物和灌木菌根真菌对日本莲代谢组的影响
对农业日益增长的需求,包括不断变化的环境条件、对可耕地日益激烈的竞争和消费者偏好的变化,要求采取创新的植物育种方法。重点是开发抗压力基因型和提高作物产量。代谢组学研究为植物代谢物提供了重要的见解,这些代谢物影响质量参数,如营养价值、味道、质地和毒性。特别是,植物与灌木菌根真菌(AM)之间的相互作用在优化农业系统方面具有巨大的潜力。这种共生关系促进植物生长,改善养分吸收,但受到灌木暂时崩溃的限制。本文研究了AM共生对模型植物莲花(Lotus japonicus)代谢组的影响。利用质谱分析和统计分析,大豆皂苷已被确定为在菌根条件下高浓度存在的标记代谢物。它们被分离出来,通过核磁共振实验进行结构表征,并在生物测定中证明了它们相对于AM真菌的杀菌特性。一种选择性的UHPLC-MS/MS方法已经被开发出来,以量化不同样品中的大豆皂素,并分析其在共生中的作用。研究表明,大豆皂苷含量降低的突变体具有更好的AM定植,这突出了它们在农业中的潜在应用。此外,还开发了一种合成渗出物(SynEx),其中含有促进共生微生物(Acidovorax delafieldii)生长的初级代谢物。这使得未来对微生物在根圈中的协同作用的研究成为可能。这些发现为植物代谢物、微生物和AM真菌之间的相互作用提供了新的见解,并为提高作物产量和功能性食品的可持续战略奠定了基础。从长远来看,这些方法可能有助于通过优化植物共生来实现更可持续的农业。农业面临的日益严峻的挑战,包括不断变化的环境条件、对可耕地的竞争加剧和消费者偏好的变化,需要在植物育种方面采取创新方法。这些努力的核心是开发抗应激基因型和改善作物产量。代谢物研究提供了对影响营养价值、味道、质地和毒性等质量参数的植物代谢物的关键见解。特别是,植物与灌木菌根真菌(AMF)之间的相互作用为优化农业系统提供了巨大的潜力。这种共生关系促进植物生长,增强营养吸收,但受到灌木暂时枯萎的限制。本研究调查了AM共生对模型植物莲花(莲花)代谢的影响。利用质谱分析和统计评估,大豆醌被确定为在菌根条件下高浓度存在的标记代谢物。这些代谢物被分离出来,通过核磁共振实验进行结构表征,并在生物试验中证明了它们对AMF的杀菌剂特性。开发了一种选择性的UHPLC-MS/MS方法来量化各种样品中的大豆素,并分析其在共生中的作用。我们观察到大豆素水平降低的突变体表现出AM定植改善,突出了它们在农业中的潜在应用。此外,还开发了一种合成排卵剂(SynEx),其中含有支持共生体如delafieldia酸vorax等微生物生长的初级代谢物。这种合成排放物促进了未来对微生物在根圈中的协同作用的研究。这些发现为植物代谢物、微生物和AMF之间的相互作用提供了新的见解,形成了改善作物产量和功能性食物的可持续战略的基础。从长远来看,这些方法可以通过优化植物共生关系促进更可持续的农业。
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