北京大学提出多尺度蛋白质语言模型，统一建模原子和残基尺度特征

本文介绍了北京大学张铭教授团队在ICML2024上提出的多尺度蛋白质语言模型ESM-AA，该模型能够统一原子尺度和残基尺度的分子建模。研究背景在于现有蛋白质语言模型主要在残基尺度上运行，限制了其在原子水平上提供信息的能力。研究目的旨在通过ESM-AA模型，实现对蛋白质和小分子应用的更深层次理解。实验结果显示，ESM-AA在蛋白质预测任务中表现优于以往方法，有效整合了分子知识到蛋白质语言模型中，同时保留了对蛋白质的理解。这一创新模型通过多尺度编码和位置编码技术，成功捕捉了残基和原子之间的关系，为蛋白质工程领域提供了新的研究工具和视角。