浙江大学在Cell子刊(IF=11.8)发表最新研究成果,绘制水稻种胚单细胞时空图谱

Ad植物微生物 2024-06-09 20:18
文章摘要
浙江大学樊龙江教授课题组与华大生命科学研究院等团队在Developmental Cell期刊上发表了关于水稻种胚单细胞时空图谱的研究。该研究利用空间和单细胞转录组测序技术,首次构建了水稻种胚单细胞分辨率的空间转录图谱,详细描绘了种子萌发过程中不同细胞类型的基因表达及营养代谢、植物激素传导的关键基因通路。研究通过深度学习模型自动分割细胞,并精细注释了水稻种胚五个主要解剖区域的细胞类型,定义了14种水稻胚细胞类型,包括新发现的盾片细胞类型。此外,研究还通过突变体实验验证了特定基因在细胞类型中的作用,并观察了萌发过程中细胞类型比例和关键基因表达的变化,为水稻胚细胞类型鉴定和种子萌发的分子机制提供了重要参考。该研究不仅加深了我们对水稻种子萌发过程的理解,也为相关领域的进一步研究奠定了基础。
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