【New Phytologist】菥蓂泛基因组的结构与序列进化

本研究基于七种菥蓂(Thlaspi arvense)基因型的完整基因组测序，构建了泛基因组资源。背景方面，菥蓂是一种耐寒、生长迅速的十字花科植物，种子含油量高，可作为冬季油料作物，但传统基因组研究方法难以全面捕捉其遗传变异。研究目的旨在系统记录菥蓂基因组结构和内容上的变异，探索基因组的进化模式。结论发现，基因稀少、重复序列丰富的着丝粒周围区域频繁发生重排和着丝粒重新定位，而基因密集的染色体臂区域保持较大尺度的共线性；NLR免疫基因簇在宏观尺度上位置保守，但微观共线性已被破坏。这些结果凸显了泛基因组资源在检测传统参考基因组无法揭示的遗传多样性方面的重要性，为该新兴生物燃料作物的育种和开发提供了有力的基因组资源。