最新Science子刊：发现炎症性乳腺癌中普遍增强的转录影响RNA剪接及血浆内含子RNA

本研究针对最具侵袭性的乳腺癌亚型——炎症性乳腺癌（IBC），其占乳腺癌病例比例虽小但致死率高，且缺乏有效靶向疗法和便捷诊断手段。研究团队利用耐热性II型内含子逆转录酶（TGIRT）对IBC患者的FFPE肿瘤组织、外周血单核细胞（PBMC）和血浆RNA进行全面测序，并开发了内含子-外显子读段深度比（IDR）分析方法。研究发现，IBC肿瘤和PBMC中存在普遍增强的转录，导致大量基因出现限速性RNA剪接，使内含子RNA在血浆中富集。特别是T细胞受体beta链基因座（TRBJ）的未剪接内含子RNA片段在IBC患者血浆中特异性高表达，可作为潜在的血浆RNA生物标志物。结论表明，该研究揭示了IBC中存在普遍增强的转录和限速性RNA剪接机制，首次发现JUN/FOS等AP-1组分过表达、TNFα-NFκB和EMT信号通路激活，以及TRBJ1-2和TRBJ1-6未剪接内含子RNA片段作为液体活检标志物的潜力，为IBC诊断和疾病监测提供了新的分子机制和生物标志物。