Nature | 曹俊越/周伟团队开发PerturbFate,实现单细胞水平CRISPR扰动的多模态同步读出
BioArt
2026-04-16 08:24
文章摘要
背景:现有的CRISPR单细胞筛选技术通常只能读取单一分子层次的信息,难以全面解析细胞状态转变的多层次协同过程。研究目的:曹俊越/周伟团队开发了PerturbFate平台,旨在将CRISPRi扰动与单细胞多组学检测深度整合,首次在单细胞水平同时捕获染色质可及性、新生RNA和稳态转录组,以系统研究复杂细胞状态转变。结论:该研究以黑色素瘤耐药模型为示范,通过对143个基因进行扰动并分析超过31万个单细胞,揭示了不同遗传扰动可汇聚于由FOSL1、KLF5等转录因子构成的共同调控枢纽,并鉴定出Hippo/YAP信号通路为核心上游驱动力及VEGFC为关键下游效应因子,证明了组合干预策略的有效性,为理解耐药机制和设计联合疗法提供了新框架。
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