iMetaOmics | 微生物所高程组利用根系宏转录组揭示丛枝菌根真菌的群落丰度、功能特征及共生互作机制

背景：丛枝菌根（AM）真菌是重要的植物共生真菌，传统ITS宏条形码技术可能低估其丰度，且对其功能与宿主互作机制了解有限。研究目的：通过田间多组学分析，验证ITS宏条形码是否系统性低估AM真菌相对丰度，并探究AM真菌与宿主植物在发育过程中的基因协同表达模式。结论：研究发现PCR-free宏转录组和宏基因组技术揭示的AM真菌相对丰度比ITS宏条形码高出6-15倍，证实了传统方法的低估现象；AM真菌相对丰度与高粱产量显著相关，可作为作物生产力的预测指标；基因共表达网络分析表明，植物与AM真菌的细胞骨架基因在生长早期协同表达以促进丛枝形成，而在后期解耦，AM真菌细胞骨架基因上调与孢子形成和有性生殖相关，揭示了共生生活史的动态调控机制。